Tujuan utama pengudaraan Rumah Hijau adalah untuk mengeluarkan haba dan kelembapan berlebihan dari rumah hijau, melaraskan komposisi udara, mengeluarkan gas berbahaya, dan memastikan suhu, kelembapan dan keadaan kualiti udara sesuai untuk pertumbuhan tumbuhan.
1. Pengudaraan Semulajadi
Rumah Kaca Kaca sangat bergantung pada pengudaraan semula jadi untuk mengawal persekitaran dalaman. Rumah Kaca Kaca pengeluaran berskala besar lazimnya adalah rumah hijau bercerun dua, berbilang rentang, dengan pengudaraan dicapai melalui tingkap pengudaraan pada dinding sisi dan rabung bumbung. Jumlah kawasan pengudaraan hendaklah tidak kurang daripada 15% daripada luas lantai rumah hijau, dan idealnya lebih daripada 30%.
Apabila tingkap rabung bumbung terbuka, selempang tingkap sebaiknya condong ke atas di atas satah mendatar, membentuk sudut 100 darjah dengan mendatar apabila terbuka sepenuhnya, untuk mencapai pengudaraan yang baik. Isipadu pengudaraan berkaitan dengan kelajuan angin, arah angin, lokasi tingkap pengudaraan, kawasan tingkap pengudaraan, dan perbezaan suhu antara bahagian dalam dan luar rumah hijau.
Apabila jumlah keluasan tingkap pengudaraan adalah 27% daripada luas lantai dalaman, jika hanya pengudaraan rabung bumbung digunakan, walaupun dengan kelajuan angin luar 10 km/j, kadar pertukaran udara yang ideal sebanyak 0.75 kali seminit tidak akan dicapai. Walau bagaimanapun, apabila kedua-dua tingkap pengudaraan rabung bumbung dan tingkap pengudaraan dinding sisi terbuka sepenuhnya, kadar pertukaran udara boleh mencapai 0.68 kali seminit walaupun dalam keadaan angin hampir sifar, menghampiri 0.75 kali seminit yang disyorkan.
2. Pengudaraan Paksa
Walaupun Rumah Kaca Kaca bergantung terutamanya pada pengudaraan semula jadi untuk mengawal persekitaran, dalam cuaca musim panas yang panas, terutamanya apabila suhu luar melebihi 33°C, pengudaraan semula jadi sahaja tidak mencukupi untuk memenuhi keperluan penyejukan rumah hijau. Oleh itu, pengudaraan paksa digabungkan dengan langkah penyejukan lain adalah amalan biasa dalam pengeluaran.
Pengudaraan paksa menggunakan kipas untuk menukar tenaga elektrik atau mekanikal lain kepada tenaga angin, memaksa aliran udara menukar udara di dalam rumah hijau dan mencapai kesan penyejukan. Had penyejukan teori pengudaraan paksa ialah apabila suhu udara dalaman menyamai suhu udara luar.
Kerana pada ketika ini perbezaan suhu antara bahagian dalam dan luar rumah hijau adalah sifar, dan jumlah pengudaraan adalah tidak terhingga, yang mustahil dalam aplikasi praktikal. Disebabkan oleh peralatan mekanikal dan fisiologi tumbuhan, keamatan pengudaraan rumah hijau biasa ialah 0.75 hingga 1.5 kali seminit, yang boleh mengawal perbezaan suhu antara bahagian dalam dan luar rumah hijau hingga dalam 5 ℃.