เมื่อสร้างเรือนกระจกจะต้องพิจารณาทุกด้าน ความเป็นภูมิภาคมีความสำคัญและจะได้รับอิทธิพลจากสภาพอากาศในท้องถิ่น

แสงแดด อุณหภูมิ ความชื้น และลมในแต่ละฤดูกาลจะส่งผลต่อผลประโยชน์ทางเศรษฐกิจของเรือนกระจกไฮโดรโปนิกส์
ก่อนที่จะสร้างเรือนกระจก ผู้ใช้ควรเข้าใจความแปรผันของอุณหภูมิในแต่ละฤดูกาล โดยเฉพาะในฤดูหนาว และให้ความสำคัญกับการทำความร้อนและความเย็นในฤดูร้อน
ทั้งหมดนี้ต้องประมาณไว้ หากไม่ทราบความแปรปรวนของสภาพอากาศ ผู้ใช้ต้องใช้เวลาในการค้นคว้าและวิเคราะห์ปัจจัยต่างๆ ที่ส่งผลต่ออุณหภูมิ เช่น ละติจูด ระดับความสูง และป่าโดยรอบ
แสงเป็นปัจจัยสำคัญที่ส่งผลต่อการสังเคราะห์ด้วยแสงของพืชและอุณหภูมิภายในอาคาร ซึ่งส่วนใหญ่ได้รับอิทธิพลจากที่ตั้งทางภูมิศาสตร์และคุณภาพอากาศ
เมื่อสร้างเรือนกระจกแบบไฮโดรโพนิก ให้เลือกพื้นที่ราบและเปิดโล่ง หลีกเลี่ยงสถานที่ระหว่างอาคารสูงหรือภายในป่าที่มีกำบัง สถานที่เหล่านี้ไม่ควรขัดขวางการระบายอากาศและแสงสว่างของเรือนกระจก
ต้องไม่ใช้ฟิล์มเรือนกระจกคุณภาพต่ำมาคลุมเรือนกระจก อุณหภูมิที่แตกต่างกันอย่างมากในฤดูหนาวอาจทำให้เกิดการรั่วไหลได้ง่าย และความชื้นสูงภายในเรือนกระจกเป็นอันตรายต่อการส่งผ่านแสง ต้องใช้ฟิล์มเรือนกระจกคุณภาพสูงเพื่อหลีกเลี่ยงปัญหาเหล่านี้
ควรพิจารณาความเร็วลมด้วย เลือกสถานที่ที่มีทั้งแสงแดดและลม หากจะปลูกเรือนกระจกแบบ Hydroponic ตลอดทั้งปี ผู้ใช้ควรคำนึงถึงทิศทางลมด้วย
สามารถระบายอากาศได้ในฤดูร้อน แต่ควรหลีกเลี่ยงในฤดูหนาว สายลมเย็นช่วยให้มั่นใจในความปลอดภัยของโครงสร้างเรือนกระจกและช่วยให้อากาศอบอุ่นในฤดูหนาว
ไม่ควรเลือกสถานที่ก่อสร้างเรือนกระจกที่ทางออกหุบเขา ลมแรงจะทำให้อายุการใช้งานของเรือนกระจก Hydroponic สั้นลง
